Биология - Филогенетическое дерево - Типы филогенетических деревьев
09 февраля 2011Оглавление:
1. Филогенетическое дерево
2. Типы филогенетических деревьев
3. Построение филогенетических деревьев
4. Ограничения использования филогенетических деревьев
Укоренённое дерево дерево, содержащее выделенную вершину корень. Укоренённое дерево можно считать ориентированным графом, поскольку на нём имеется естественная ориентация от корня к листьям. Каждый узел укоренённого дерева отвечает последнему общему предку нижележащих листьев дерева. Рисунок 1 представляет укоренённое филогенетическое дерево, окрашенное в соответствии с трёхдоменной системой живых организмов. .
Неукоренённое дерево не содержит корня и отражает связь листьев без предполагаемого положения общего предка. Необходимость рассматривать неукоренённые деревья возникает из-за того, что часто связи между узлами восстановить легче, чем направление эволюции. Рисунок 2 представляет неукоренённое филогенетическое дерево. . Наиболее достоверным методом для превращения неукоренённого дерева в укоренённое является использование «внешней группы» видов достаточно близких к интересующему нас набору видов, но в то же время заведомо являющихся отдельной группой. Иногда положение корня можно угадать, исходя из каких-либо дополнительных знаний о природе изучаемых объектов
Укоренённое и неукоренённое филогетическое дерево может быть бифуркационным или небифуркационным, а также маркированным или немаркированным. В бифуркационном дереве к каждому узлу подходят ровно три ветви. Таким образом бифуркационное дерево предполагает, что все эволюционные события состояли в происхождении от предкового объекта ровно двух потомков. К узлу небифуркационного дерева могут подходить четыре и более ветви. Маркированное дерево содержит названия листьев, тогда как немаркированное просто отражает топологию.
общий термин, обозначающий схематическое представление филогенетического дерева.
Кладограмма филогенетическое дерево, не содержащее информации о длинах ветвей.
Филограмма филогенетическое дерево, содержащее информацию о длинах ветвей; эти длины представляют изменение некой характеристики.
Хронограмма филограмма, длины ветвей в которой представляют эволюционное время.
Просмотров: 14716
|