Биология - Метод дробовика
09 февраля 2011Оглавление:
1. Метод дробовика
2. Пример
Метод дробовика — метод, используемый для секвенирования длинных участков ДНК. Суть метода состоит в получении случайной массированной выборки клонированных фрагментов ДНК данного организма, на основе которых может быть составлена его геномная библиотека.
Поскольку обычные методы секвенирования могут быть применимы только к коротким отрезкам ДНК, более длинные последовательности можно разделить на фрагменты, а затем собрать заново, чтобы получить полную последовательность большого участка ДНК. Для этого используются два основных метода: хромосомная ходьба, который позволяет определить шаг за шагом последовательность большого участка ДНК и данный метод, который намного быстрее, но и сложнее, так как используются случайные фрагменты ДНК, которые затем необходимо собрать вместе.
При секвенировании методом дробовика ДНК случайным образом фрагментируется на мелкие участки, которые затем секвенируют обычными методами, например, методом Сэнгера. Полученные перекрывающиеся случайные фрагменты ДНК затем собирают с помощью специальных программ в одну целую большую последовательность, однако, при сборке некоторые затруднения представляют повторенные последовательности ДНК.
Метод дробовика применяли для получения первых полных геномов организмов.
Просмотров: 9640
|
|